蔣經國認為：「古寧頭戰役是國民黨的轉折點。」胡璉說：「古寧頭戰役的勝利既是軍事上的，也是政治上的，更是JiNg神上的。」
認為因為解放軍在古寧頭戰役慘敗，加上11月3日登步島戰役，使解放軍對登陸戰艱鉅有深刻了解，解放軍積極加強建設海空力量，不像過去單靠陸軍登陸作戰。
東南軍政長官陳誠謂之：「是共軍渡江以來碰到的第一個大釘子。」而中華民國代總統李宗仁特以此捷，於重慶致電陳誠申賀，謂：
特急，臺北陳長官辭修兄：
金門守軍奮勇應戰，予以重劊，捷報傳來，人心振奮，吾兄董督有方，將士用命，至足佩慰。希即傳令嘉獎，查明有功將士，呈報國防部，分別獎賞，并盼再接再厲，晉建殊勳，無任企望。
李宗仁
1949年11月3日，蔣在「敵我雙方優勢之分析」的訓詞中，曾說：
「此次金門保衛戰的結果，對於來犯之匪萬余人，予以徹底的殲滅，不使有一人脫逃漏網，這是我們剿匪以來最大的一次勝利。」
其後，於1950年4月，特別頒發團T榮譽旗，以獎參與此役特著功績之第一一八師及第十八師。
鑒於古寧頭戰役慘敗，在第四野戰軍發動海南島戰役前，專門發電報要求四野向第三野戰軍調查渡海作戰經驗，以免重蹈金門覆轍。
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