項目雖然立項，但如同吳浩所說的那樣，所遇到的困難和問題特別的多而且分歧也比較大。
有技術專家認為，應該著眼于目前我們已經成熟的建木一號，或者是建木二號一級火箭的箭體，來設計研發太空巴士航天飛行器。
這樣做的好處就是穩健，有很多成熟的技術可以借鑒，而且研發投入相對較少。至于缺點嘛，自然也很明顯，不管是建木一號還是二號，運載能力都非常有限，很難將超重的航天飛行器運輸上天，更別說是什么載荷了。
而且火箭箭體直徑有限，所能夠搭載的飛行器體積也非常有限，所以這類飛行器的用途則就非常有限了。
所以有專家認為，我們可以不局限于我們自己的火箭，可以設計制造能夠搭載在其它火箭上的太空巴士航天飛行器。
比如已經逐漸趨于成熟的長5火箭，一級箭體直徑足夠大，且還有助推器，能夠運輸更重的載荷。以此為基礎的話，那么項目團隊完全可以研發制造出了一艘和真巴士差不多大小的飛行器。這樣一來，不管是載物，還是載人，用途都十分明顯。
這個方案自然非常的好，但也有缺點，首先就是研發投入了，這么大的太空飛行器，其研發成本有多少，這個誰都無法估量。
其次就是技術難度了，不管是載荷還是體積沒大一個數量，難度都將成倍上升。
所以這位專家擔心，一下子投入這樣巨大的項目，風險太大。
最終在經過激烈討論，且綜合大家的意見后，吳浩最終做出決定，先投資研發能夠搭載在建木一號和二號上發射的中小型航天飛行器。
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